يتخصص قسم علم الأحياء الدقيقة وعلم الوراثة الميكروبية في الكشف عن الأمراض المعدية وتشخيصها في مجال علم الجراثيم وعلم الفيروسات وعلم الفطريات.

يقدم القسم نتائج دقيقة حول المواد السريرية في أقصر وقت ممكن. باستخدام أحدث المعدات، ينفذ القسم مجموعة كاملة من خدمات علم الأحياء الدقيقة عالية الجودة، من الثقافات الروتينية إلى الاختبارات التشخيصية الجزيئية.

يتمثل الدور الأساسي لمختبر علم الأحياء الدقيقة وعلم الوراثة الميكروبي في رعاية المرضى في مساعدة الأطباء في تحديد العوامل المسببة للأمراض المعدية المختلفة والمساعدة في تحديد ملامح الحساسية لمضادات الميكروبات، واكتشاف البكتيريا المقاومة المتعددة، عند الاقتضاء. تتيح المعلومات المقدمة من مختبر علم الأحياء الدقيقة والجينات الميكروبية للأطباء بدء العلاج أو تعديله، مما سيكون له تأثير مباشر على نتائج المريض.

من أجل مساعدة علم الأحياء الدقيقة في تشخيص الأمراض المعدية الصحيحة، يتم اتخاذ عدد من الخطوات. الخطوة الأولى هي جمع العينات المناسبة لتشخيص مرض المريض. يمكن جمع العينات من عدد من المصادر المختلفة، بما في ذلك عينات الدم والبول والمسحات. في بعض الأحيان، يلزم استخدام تقنية أكثر توغلاً باستخدام إبرة أو أداة خاصة أخرى لجمع العينة. هذه الخطوة الأولى في تشخيص الأحياء الدقيقة للأمراض المعدية مهمة جدًا! إن العينة الجيدة تعني أفضل فرصة لتشخيص المرض المعدي.

بعد جمع العينة والمدخلات من الطبيب حول ماهية المرض المعدي المحتمل، يقرر المختبر الأسلوب الأفضل لتحديد المرض المعدي والكائن الحي الذي يحتمل أن يسبب المشكلة. تبحث جميع التقنيات عن بعض منتجات الكائن الحي. الوقت الذي يستغرقه تحديد الكائن الحي يعتمد على التقنية المستخدمة، وكذلك مدى تعقيد عملية الاختبار. بالنسبة للمريض، هذا يعني أن المختبر قد يكون قادرًا على تقديم إجابة في أي مكان من 15 دقيقة إلى ثمانية أسابيع!

علم الوراثة الميكروبية

فيروس التهاب الكبد الوبائي B

هو واحد من عدة فيروسات معروفة بأنها تسبب التهاب الكبد الفيروسي. يتعرض حاملو الأمراض المزمنة لخطر الإصابة بمضاعفات طويلة الأمد للعدوى، بما في ذلك التهاب الكبد المزمن وتليف الكبد وسرطان الخلايا الكبدية. يعد تحديد كمية الحمض النووي الفيروسي HBV طريقة موثوقة لقياس التكاثر الفيروسي للفيروس، ولرصد الاستجابة للعلاج.

المنهجية

يعتمد على تفاعل البوليميراز المتسلسل في الوقت الحقيقي. وهذا يشمل معالجة الحمض النووي، والتضخيم والكشف في نفس الوقت باستخدام مجسات صبغة مراسل الفلورسنت.

فيروس التهاب الكبد الوبائي C

يعتبر العامل الرئيسي المسؤول عن 90-95٪ من حالات التهاب الكبد غير A و non-B بعد نقل الدم. يوفر الكشف عن HCV RNA وتحديد كمياته مقياسًا لفيروسات الدم النشطة. إنه يجعل من الممكن الكشف عن التغيرات في الحمل الفيروسي في المرضى المصابين بفيروس التهاب الكبد الوبائي المزمن الموجب للأجسام المضادة والذين يخضعون للعلاج بالإنترفيرون.

المنهجية

يعتمد على عزل HCV RNA و RNA - النسخ العكسي و Real-Time Polymerase Chain Reaction PCR (التضخيم والكشف في وقت واحد باستخدام تحقيقات صبغة مراسل الفلورسنت).

الأمراض المنقولة جنسيا (STDs)

تمثل مجموعة من الأمراض التي تؤثر على الصحة الجنسية والإنجابية لملايين الأشخاص، كونها مشكلة عامة تهم الجمهور. تشمل العوامل المسببة للأمراض التي تنتقل عن طريق الاتصال الجنسي الفطريات والبكتيريا والطفيليات والفيروسات. يتم التخلص من بعض هذه الكائنات الحية الدقيقة بعد فترة من الزمن، بينما يتكرر البعض الآخر ويبقى البعض في الجسم بدون أعراض، مما يسمح بتطور المرض وتوليد عواقب مثل التهابات المسالك البولية والتناسلية والعقم وحتى تطور السرطان .

تتضمن اللوحة ؛ النيسرية البنية، المتدثرة الحثرية، الميكوبلازما التناسلية، اللولبية الشاحبة وأنواع فيروس الهربس البسيط 1 أو 2 (HSV-1/2)

المنهجية

يعتمد على تفاعل البوليميراز المتسلسل في الوقت الحقيقي. وهذا يشمل معالجة الحمض النووي، والتضخيم والكشف في نفس الوقت باستخدام مجسات صبغة مراسل الفلورسنت.

فيروس الورم الحليمي البشري (HPV)

مسؤول عن مجموعة متنوعة من اضطرابات الجلد والأغشية المخاطية. قد تختلف المظاهر السريرية حسب الموقع التشريحي للآفة ونوع فيروس الورم الحليمي البشري المعني.

يتم تقسيم فيروس الورم الحليمي البشري التناسلي بشكل عام إلى فئتين: تلك التي لديها مخاطر محتملة منخفضة على الأورام (مجموعة منخفضة المخاطر) وتلك التي لديها مخاطر محتملة عالية من الأورام (مجموعة عالية المخاطر). يرتبط فيروس الورم الحليمي البشري عالي الخطورة بشكل عام بآفات سرطانية عالية الدرجة وسرطان غازي، في حين أن فيروس الورم الحليمي البشري منخفض الخطورة كثيرًا ما يوجد في حالات غير مصحوبة بأعراض أو حميدة مثل الثآليل التناسلية.

المنهجية

يعتمد على مبدأ التهجين العكسي ويسمح بالكشف والتعرف النوعي على 37 فيروسًا من فيروس الورم الحليمي البشري التناسلي (أنماط وراثية منخفضة وعالية الخطورة) في عينات الحمض النووي المأخوذة من مسحات أو خزعات عنق الرحم.

السل الفطري

للكشف عن مرض السل وتشخيصه.

المنهجية

يعتمد على تفاعل البوليميراز المتسلسل في الوقت الحقيقي. وهذا يشمل معالجة الحمض النووي، والتضخيم والكشف في نفس الوقت باستخدام مجسات صبغة مراسل الفلورسنت.

لوحة مسببات الأمراض التنفسية

هو اختبار نوعي لتحليل 20 هدفا لمسببات الأمراض الشائعة المسببة لالتهابات الجهاز التنفسي الحادة. تستخدم هذه اللوحة تقنيات اختبار وعينات QIAGEN القوية، لتقديم عينة حقيقية لحل Insight.

18 فيروسات: Adenovirus، Bocavirus، Coronaviruses (229E، HKU1، NL63، OC43)، metapnemovirus A / B، فيروسات الإنفلونزا (A، النوع الفرعي H1N12009، النوع الفرعي H1، النوع الفرعي H3، B)، فيروسات الإنفلونزا (1،2،3، 4)، فيروس الجهاز التنفسي المخلوي A / B، فيروس الأنف، الفيروس المعوي.

3 بكتيريا: البورديتيلا الشاهوق، الليجيونيلا الرئوية، الميكوبلازما الرئوية.

لوحة مسببات الأمراض المعدية المعوية

يشمل مسببات الأمراض الفيروسية والبكتيرية والطفيلية الأكثر شيوعًا التي تسبب التهابات الجهاز الهضمي، والتي تظهر عمومًا بعلامات وأعراض لا يمكن تمييزها تقريبًا.

تساعد المعرفة السريعة والدقيقة لوجود أو عدم وجود العوامل المسببة في اتخاذ قرارات في الوقت المناسب بشأن دخول المستشفى والعلاج ومكافحة العدوى وعودة المريض إلى العمل والأسرة. علاوة على ذلك، قد يدعم بشكل كبير الإشراف على مضادات الميكروبات ومبادرات الصحة العامة الهامة الأخرى.

14 بكتيريا: توكسين المطثية العسيرة A / B، الإشريكية القولونية (الإشريكية القولونية المعوية (ETEC) الإشريكية القولونية المعوية (EPEC)، الإشريكية القولونية المعوية (EIEC) الإشريكية القولونية المعوية (EAEC) الشيغا مثل السم المنتجة للإشريكية القولونية،)، العطيفة الممرضة (C. jejuni (نوع فرعي jejuni) C. coli.، C. upsaliensis)، Plesiomonas Shigelloids، السالمونيلا، Vibrio Spp. (الكوليرا)، V. parahaemolyticus، و V. vulnificus. )، يرسينيا القولون.

4 طفيليات: Cyclospora cayetanensis، Cryptosporidium، Entamoeba histolytica، Giardia lambia.

6 فيروسات: Adenovirus، Astrovirus، Norvirus (GI، GII)، Rotavirus A، Sapovirus (I، II، IV، V).

لمعلومات أكثر، يرجى الاتصال:

• رند شويحات، رئيس قسم الروتين والأحياء الدقيقة، r.shwayhat@biolab.jo
• نور عواملة، أخصائي في علم الوراثة، n.awamleh@biolab.jo
• لينا محمد، مديرة المختبر، l.mohammad@biolab.jo